De acuerdo al QS World University Rankings, la Universidad Nacional Mayor de San Marcos (UNMSM) se encuentra entre las mejores 1000 universidades a escala mundial tras ser evaluada en diversos ítems de calidad académica, investigación e innovación.

Dicha universidad se encuentra en la categoría 801-1000, con una reputación global de 33.8/100. Además, es la única universidad pública del país que ha logrado ingresar a esta importante lista, en la que también figuran la Pontificia Universidad Católica del Perú (432) y a la Universidad Peruana Cayetano Heredia (en la categoría 701-750). 

Asimismo, el Instituto Tecnologico de Massachusetts (MIT) figura en el primer lugar, seguido por las universidades estadounidenses Stanford, Harvard y al Instituto Tecnológico de California, en segundo, tercer y cuarto puesto, respectivamente. En quinta posición se encuentra la Universidad de Oxford (Inglaterra).

Es importante mencionar que esta clasificación se basa en seis indicadores: la reputación académica (con una encuesta a miles de académicos), reputación desde el punto de vista del empleador, citas por profesor, ratio de estudiantes por profesor, ratio de profesores internacionales y de estudiantes internacionales.

No obstante, estos indicadores tienen diferente porcentaje de evaluación, tales como reputación académica (40 %), reputación entre empleadores (10 %), ratio académicos/estudiantes (20 %), citas por académico (20 %), profesores internacionales (5 %) y estudiantes internacionales (5%).

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